SBI証券の同じ口座を別アカウントでも設定して利用できますか？

可能です。
ただし、極めて近い時間に同時に発注が行われると、動作が不安定になることがございますので、同時刻に発注が起こりにくいようそれぞれのアカウントで注文設定を行うのが望ましいです。